Статья опубликована в рамках: XXXII Международной научно-практической конференции «Естественные и математические науки в современном мире» (Россия, г. Новосибирск, 01 июля 2015 г.)
Наука: Информационные технологии
Секция: Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ
Скачать книгу(-и): Сборник статей конференции
- Условия публикаций
- Все статьи конференции
дипломов
Статья опубликована в рамках:
Выходные данные сборника:
К ВОПРОСУ О РОЛИ ПОЛИПЛОИДИИ ПРИ АНАЛИЗЕ НАРУШЕНИЙ МЕТАБОЛИЗМА, ОБУСЛОВЛЕННЫХ АКТИВИЗАЦИЕЙ ТРАНСПОЗОНОВ
Бутов Александр Александрович
д-р физ.-мат. наук, профессор, заведующий кафедрой прикладной математики
Ульяновского государственного университета,
РФ, г. Ульяновск
E -mail: pm@ulsu.ru
Карев Михаил Андреевич
аспирант,
Ульяновский государственный университет,
РФ, г. Ульяновск
E -mail: misha5490mk@yandex.ru
Коваленко Анатолий Александрович
студент магистратуры,
Ульяновский государственный университет,
РФ, г. Ульяновск
E -mail: anako09@mail.ru
Кононова Галина Викторовна
студент магистратуры,
Ульяновский государственный университет,
РФя, г. Ульяновск
E-mail:
ON THE QUESTION ABOUT A CONTRIBUTION A POLYPLOIDY ANALYZE A METABOLIC IMBALANCE ASSOCIATED WITH TRANSPOSONS ACTIVATION
Alexander Butov
doctor of Physical and Mathematical Sciences, professor, head of the department of Applied Mathematics,
Ulyanovsk State University,
Russia, Ulyanovsk
Mikhail Karev
postgraduate student,
Ulyanovsk State University,
Russia, Ulyanovsk
Anatolyi Kovalenko
master’s student,
Ulyanovsk State University,
Russia, Ulyanovsk
Galina Kononova
master’s student,
Ulyanovsk State University,
Russia, Ulyanovsk
АННОТАЦИЯ
В настоящей работе представлен принцип построения модели на основе телеграфных процессов в семимартингальных терминах митоточески активных клеток, учитывается явление полиплоидии, эффект активации транспозонов. Сформулирована теорема.
ABSTRACT
This article presents the principle of formation the model in terms of telegraph process and semimartingals of mitotic activity cells considering polyploidy, transposons activation. A theorem was formulated.
Ключевые слова: транспозон; полиплоидия; семимартингал.
Keywords: transposon; polyploidy; semimartingal.
1. Пусть = — стохастический базис с обычными условиями Деллашери [1]. Пусть при заданы точечные процессы и , определяющие позиции активных транспозонов на хромосомах с нормированными длинами (равными 1). В таких обозначениях наличие активных транспозонов может быть обозначено единичным значением процесса телеграфного типа
(1)
с процессами и , имеющими компенсаторы
, , (2)
Обозначим . Тогда, очевидно, выполняется соотношение
(3)
Обозначим среднюю длину транспозона .
Тогда, очевидно
(4)
поскольку, как следует из уравнения (3)
(5)
(при стационарном распределении, наблюдаемом в экспериментах и, следовательно, выполняется (5)).
Из (4) вытекает полезное соотношение для соотношения частоты затухания активности транспозонов и их средней длины
(6)
2. В настоящей работе рассматривается модель митотически активных (т. е. не постмитотических, и не клеток с затухающей митотической активностью). Для таких клеток характерно явление полиплоидии.
Наряду с многими, как положительными, так и отрицательными эффектами этого явления, наблюдается некоторая взаимосвязь его с эффектами активации транспозонов. Эта взаимосвязь проявляется в существовании некоторых компромиссных уровней (как полиплоидии, так и активации транспозонов), которые позволяют достигать значений, оптимальных с точки зрения угроз канцерогенеза, с одной стороны, и мутагенеза активации транспозонов, с другой стороны.
Пусть в клетке существует (идентичных) копий хромосомы. Тогда локусы активности транспозонов, разрушающие работу нормальной ДНК могут быть обозначены со средними значениями на всех хромосомах равными
(7)
Последнее равенство следует, очевидно из того, что , поскольку при
и, следовательно
, (8)
что приводит к нарушениям экспрессии генов за время , пропорциональное величине
(9)
Таким образом, оптимизация работы генома предполагает за некоторое время минимизацию
(10)
Однако, полиплоидия (и это особенно наглядно демонстрирует поведение гепатоцитов) приводит к росту угрозы канцерогенеза, который можно в первом приближении представить в виде вероятности
(11)
с задачей
(12)
где — коэффициент канцерогенной активации генов на любой из аллельных хромосом при -полиплоидии.
Таким образом при формировании полиплоидных структур (наряду с иными задачами и причинами её возникновения) решается задача оптимизации, аддитивно формирующаяся из подзадач (10) и (12):
, (13)
где — некоторый, экспериментально (на основе эволюционного обоснования полиплоидии) определяемый коэффициент пропорциональности.
Заметим, что количество активных транспозонов существенно ниже их общего числа. Это приводит к соотношению , а также к тому, что , поскольку общая генетическая масса активных транспозонов существенно меньше общего объема хромосомы.
Следовательно, задача (13) редуцируется в приближенную задачу
(14)
поскольку
Теорема. Решение задачи (14) существует и определяется трансцендентным уравнением
,
где .
Замечание. Решение не только существует, положительно, но и допускает оценку .
Список литературы:
1.Бутов А.А. Теория случайных процессов / А.А. Бутов, К.О. Раводин. Ульяновск: УлГУ, 2009. — 62 с.
2.Карев М.А. Имитационная стохастическая модель динамики размножения транспозонов / М.А. Карев, А.А. Бутов // Естественные и технические науки. — 2013. — № 5(67). — С. 310—315. — ISSN 1684-2626.
дипломов
Оставить комментарий