Статья опубликована в рамках: IX Международной научно-практической конференции «Научное сообщество студентов XXI столетия. ЕСТЕСТВЕННЫЕ НАУКИ» (Россия, г. Новосибирск, 04 апреля 2013 г.)
Наука: Биология
Скачать книгу(-и): Сборник статей конференции
- Условия публикаций
- Все статьи конференции
дипломов
АНАЛИЗ АССОЦИАЦИИ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНА IL-4 (C590T) С ВОЗНИКНОВЕНИЕМ БРОНХИАЛЬНОЙ АСТМЫ У ДЕТЕЙ
Щаюк Анна Николаевна
студент 5 курса, кафедра генетики биологического факультета БГУ, г. Минск
Крупнова Эвелина Вячеславовна
научный руководитель, канд. биол. наук, доцент, ГНУ «Институт генетики и цитологии НАН Беларуси», г. Минск
Атопическая бронхиальная астма (БА) — одно из наиболее распространенных и тяжелых мультифакторных заболеваний. По социально-экономическому ущербу, влиянию на уровень здоровья и качество жизни пациентов, бронхиальная астма входит в число одних из основных патологий в структуре заболеваний человека [1; 3]. Эта болезнь является следствием аллергической реакции и обусловлена смежным взаимодействием иммунокомпетентных клеток, медиаторов, клеток и тканей бронхов, приводящим к отеку бронхиальной стенки, гиперсекреции и перестройке бронхиального дерева [7; 15].
Особо важную роль в реализации атопических реакций играют цитокины — внеклеточные протеины или гликопротеины, которые необходимы для межклеточных взаимодействий. Они обеспечивают передачу сигнала между клетками, связываясь с соответствующими рецепторами на поверхности клеток-мишеней. Цитокины воздействуют на клетки и вызывают активацию их пролиферации, синтеза и высвобождения других цитокинов и медиаторов, а также стимулируют рост, дифференцировку и апоптоз различных клеток иммунной системы [5; 6].
Раскрытие деталей этиологии и патогенеза БА привело к пониманию важной роли в этих процессах интерлейкинов, которые ответственны за индукцию и поддержание воспаления при данном заболевании. Интерлейкины участвуют в формировании, контроле и регуляции воспалительного процесса в дыхательных путях. Гены этих цитокинов расположены тандемно в одном кластере на хромосоме 5q31-33 [8; 14]. Данный локус рассматривается как один из «кандидатов», определяющих развитие БА.
Интерлейкин 4 (IL-4) является ключевым цитокином в развитии аллергического воспаления. Известно, что полиморфизм гена IL-4 в промоторной области С590Т приводит к усилению промоторной активности гена и повышению концентрации сывороточного IgE [2; 12; 13].
Целью исследования явилось изучение ассоциации полиморфного варианта гена IL-4 (C590T) с риском возникновения атопической БА у детей, проживающих в Республике Беларусь.
Материалы и методы
Обследован 231 ребенок (162 мальчика и 69 девочек) в возрасте от 3 до 18 лет, страдающих атопической бронхиальной астмой, находившихся на лечении в УЗ «4-ая городская детская клиническая больница» г. Минска. Всем пациентам был поставлен диагноз «атопическая бронхиальная астма» на основании клинических проявлений и результатов биохимических исследований. В контрольную выборку вошли 111 человек (55 мальчиков и 56 девочек) без признаков аллергической патологии соответствующего пола и возраста.
Выделение ДНК из периферической крови проводили по методике, описанной Mathew [11]. В ходе выполнения работы методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) и методом анализа полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ) был исследован полиморфизм гена IL-4 (C590T). ПЦР проводили на амплификаторе MyCyclerTM Termal cycler «BIORAD», США. Праймеры, использованные в работе: F:5'-ACTAGGCCTCACCTGATACG-3', R:5'-GTTGTAATGCAGTCCTCCTG-3'. Условия проведения ПЦР: 94˚ — 5; (94˚ — 30΄΄, 60˚ — 30΄΄, 72˚ — 30΄΄) — 32 цикла; 72˚ — 5΄; 4˚ — ∞ [9].
Для изучения полиморфизма IL-4 (C590T) в области промотора гена IL-4 амплифицированый фрагмент длиной 254 п. н. подвергали рестрикционному расщеплению эндонуклеазой BsmFI. Продукты рестрикции фракционировали в 2,0 % агарозном геле и визуализировали в УФ-свете. Генотипы IL-4 идентифицировали по длине полученных в ходе рестрикции фрагментов:
CC (210 п. н.+ 44 п. н.); CT (254 п. н.+ 210 п. н.+ 44 п. н.); TT (254 п. н.).
Статистическая обработка данных проводилась с использованием пакета прикладных программ “Statistica for Windows 6.0”. При сравнении частот генотипов использовался стандартный критерий c² Пирсона. Об ассоциации генотипов с предрасположенностью к БА судили по величине отношения шансов (odds ratio, ОR) — показателю, показывающему, во сколько раз вероятность оказаться в группе «случай» (больные) отличается от вероятности оказаться в группе «контроль» (здоровые) для носителя изучаемого генотипа. Величину отношения шансов рассчитывали по стандартной формуле ОR=(A/B)/(C/D), где A и B — количество больных, имеющих и не имеющих мутантный генотип, соответственно, и C и D — количество человек в контрольной группе, имеющих и не имеющих мутантный генотип. При OR=1 ассоциация отсутствовала, OR>1 рассматривали как положительную ассоциацию заболевания с исследуемым генотипом («фактор риска») и OR<1 — как отрицательную ассоциацию («фактор устойчивости»). OR указан с 95 %-ным доверительным интервалом.
Результаты и обсуждение
Разработка современных достоверных методов, позволяющих диагностировать БА на раннем этапе развития, формировать группы риска с целью проведения первичной профилактики развития БА, а также прогнозировать особенности течения этих заболеваний, является одной из актуальных проблем биологии и медицины. Перспективными для этих целей являются исследования, посвященные изучению генетических основ БА. Сравнение частоты встречаемости отдельных аллелей и генотипов у больных БА дает возможность составить представление о сходстве или различии изучаемых генетических особенностей в исследованных группах при этом заболевании.
Для выяснения ассоциации полиморфизма изучаемого гена с риском возникновения атопической БА проводили сравнительный молекулярно-генетический анализ распределений частоты встречаемости полиморфных генотипов в группах пациентов с контролем. Результаты анализа распределения частоты полиморфных вариантов гена IL-4 у детей, больных БА и в контрольной группе представлены в таблице 1.
Таблица 1.
Распределение частот встречаемости генотипов IL-4 в группе больных БА и в контрольной группе
Генотип |
Контроль |
Больные БА |
OR (95 %CI) |
||
n |
% |
n |
% |
||
IL-4 (C590T) |
111 |
231 |
|||
CC CT TT |
78 32 1 |
70,3 28,8 0,9 |
131 84 16 |
56,7 36,4 6,93 |
0,56 (0,36—0,9)* 1,4 (0,86—2,28) 8,19 (1,07—62,54)** |
Примечание: * — p=0,022, р — уровень значимости различий по критерию c2 с контрольной группой; ** — p=0,033, р — уровень значимости различий по критерию c2 с контрольной группой
Согласно полученным данным обнаружено, что в контрольной группе генотип 590СС встречается достоверно чаще, чем в объединенной группе больных атопической БА (ОR=0,56; 95 %CI: 0,36—0,9), что говорит о значительной роли данного генотипа в защитных процессах организма в отношении риска возникновения БА. В группе больных БА отмечено увеличение частоты генотипа 590ТТ в 7,7 раза по сравнению с контрольной группой (ОR=8,19; 95 %CI: 1,07—62,54), т. е. у носителей этого генотипа (590ТТ) повышен риск возникновения БА.
Так как, в группе исследованных больных атопической БА встречались различные формы этого заболевания, то проводился сравнительный молекулярно-генетический анализ распределений частот встречаемости полиморфных генотипов IL-4 в следующих группах больных: изолированная форма БА; БА и аллергический ринит (АР); БА и атопический дерматит (АД); БА с аллергическим ринитом и атопическим дерматитом.
Группа пациентов с изолированной формой бронхиальной астмы составляет 32,9 % из больных атопической БА. При анализе распределения частоты встречаемости полиморфных генотипов IL-4 у этих больных (таблица 2) было также выявлено достоверно значимое отличие частоты встречаемости генотипа 590СС: в контрольной группе данный генотип встречается в 1,3 раза чаще, чем в группе больных с изолированной формой БА (ОR=0,47; 95 %CI: 0,26—0,86). Исходя из результатов анализа, полученных в группе больных атопической БА и группе больных с изолированной формой БА, данный генотип играет важную роль в защитных процессах организма в отношении риска возникновения БА.
Таблица 2.
Распределение частот встречаемости генотипов IL-4 у больных с изолированной формой БА и в контрольной группе
Генотип |
Контроль |
Больные с изолированной формой БА |
OR (95 %CI) |
||
n |
% |
n |
% |
||
IL-4 (C590T) |
111 |
76/231 |
32,9 |
||
CC CT TT |
78 32 1 |
70,3 28,8 0,9 |
40 32 4 |
52,6 42,1 5,3 |
0,47 (0,26—0,86)* 1,79 (0,97—3,29) 6,11 (0,7—29,71) |
Примечание: * — p=0,021, р — уровень значимости различий по критерию c2 с контрольной группой
Наиболее распространенным сочетанием является БА и АР, составляющим 42,4 % из общей группы больных БА (таблица 3). Для этой группы показано статистически значимое отличие частоты встречаемости генотипа 590TT: в группе больных он встречается в 10 раз чаще, чем в контрольной группе (ОR=11,12; 95 %CI: 1,38—89,47). Этот генотип имеет рисковую значимость в отношении риска возникновения БА, сочетанной с АР.
Атопическая БА, сочетанная с АД, встречается реже (6,9 % из общей группы больных БА). При анализе распределения частоты полиморфных генотипов IL-4 в этой группе достоверно значимых отличий обнаружено не было (таблица 3).
Таблица 3.
Распределение генотипов IL-4 у больных БА, сочетанной с АР и с АД, и в контрольной группе
Генотип |
Контроль |
Больные БА, сочетанной с АР |
OR (95 %CI) |
Больные БА, сочетанной с АД |
OR (95 %CI) |
|||
n |
% |
n |
% |
n |
% |
|||
IL-4 (C590T) |
111 |
98/231 |
42,4 |
16/231 |
6,9 |
|
||
CC CT TT |
78 32 1 |
70,3 28,8 0,9 |
58 31 9 |
59,2 31,6 9,2 |
0,61 (0,39—1,09) 1,14 (0,63—2,06) 11,12 (1,38—89,47)* |
10 5 1 |
62,5 31,3 6,2 |
0,71 (0,24—2,1) 1,12 (0,36—3,49) 7,33 (0,7—72,89) |
Примечание: * — p=0,013, р — уровень значимости различий по критерию c2 с контрольной группой
Частота встречаемости БА, сочетанной с АР и АД, составляет 14,7 % от общего числа больных БА. Анализ распределения частоты полиморфных генотипов IL-4 в этой группе не показал статистически значимых отличий от контрольной группы (таблица 4).
Таблица 4.
Распределение частот встречаемости генотипов IL-4 у больных БА, сочетанной с АР и АД, и в контрольной группе
Генотип |
Контроль |
Больные БА, сочетанной с АР и АД |
OR (95 %CI) |
||
n |
% |
n |
% |
||
IL-4 (C590T) |
111 |
34/231 |
14,7 |
||
CC CT TT |
78 32 1 |
70,3 28,8 0,9 |
18 14 2 |
52,9 41,2 5,9 |
0,48 (0,22—1,05) 1,65 (0,75—3,66) 6,88 (0,60—78,29) |
Таким образом, исследование полиморфных вариантов гена IL-4 c риском возникновения атопической бронхиальной астмы показало, что:
1. генотип 590ТТ ассоциирован с риском возникновения этой патологии;
2. генотип 590 СС играет защитную роль в отношении риска возникновения БА.
Работа выполнялась в рамках ГПНИ «Фундаментальные основы биотехнологий (Геномика)» совместно с сотрудниками 4-ой городской детской клинической больницы г. Минска.
Список литературы:
- Балаболкин И.И. Современная концепция патогенеза бронхиальной астмы у детей // Иммунология, аллергология, инфектология, 2006, № 1. — С. 26—35.
- Берсимбай Р.И., Роль полиморфизма генов в предрасположенности к бронхиальной астме и хронической обструктивной болезни легких // Вестник ЕНУ им. Л.Н. Гумилева, 2010, № 1. — С. 401—411.
- Давидовская Е.И. Бронхиальная астма сегодня — проблемы и решения / Е.И. Давидовская, Т.В. Барановская — Мн. : БелМАПО, 2006. — 13 с.
- Даниляк И.Г. Бронхиальная астма. Практическое пособие для терапевтов / И.Г. Даниляк, А.Д. Пальман — М.: НЬЮДИАМЕД, 2009. — 68 с.
- Кетлинский С.А. Роль Т-хелперов 1 и 2 в регуляции клеточного и гуморального иммунитета // Иммунология. 2003. № 2. — С. 77—79.
- Манина И.В. Иммунопатология и биохимические основы терапии атопических состояний // Лечащий врач, март 2012, № 3. [Электронный есурс] — Режим доступа. — URL: http://apteka-club.ru/uploads/articles/tavegil/Manina_Klimastin.pdf (дата обращения 27.03.2013).
- Фрейдин М.Б., Генетика атопии: современное состояние // Вестник ВОГиС, 2006. Том 10. — № 3. — C. 492—502.
- Arai K.I. Cytokines: coordinators of immune and inflammatory responses // Ann. Rev. Biochem., 1990. — V. 59. — P. 783—802.
- Li H. Single-Nucleotide Polymorphisms in Genes Predisposing to Asthma in Children of Chinese Han Nationality // J Investig Allergol Clin Immunol, 2009; V. 19 (5). — Р. 391—395.
- Malerba G. A review of asthma genetics: gene expression studies and recent candidates / G. Malerba, P.F. Pignatti // Genet 46 (1). — 2005. — Р. 93—104.
- Mathew C.C. The isolation of high molecular weight eucaryotic DNA // in Walker JMNJ (ed): Methods in Molecular Biology, Clifton: Human Press, 1984. — Vol. 2. — P. 31—34.
- Rockman M.V. Positive selection on a human-specific transcription factor binding site regulating IL-4 expression // Curr Biol., 2003. — V. 13 (23). — P. 2118—2123.
- Rosenwasser L.J. Genetics of atopy and asthma — promoter-based candidate gene studies for IL-4 // International archives of allergy and immunology, 1997. — V. 113. — P. 61—64.
- Walley A.J., Cookson W.O. Investigation of an interleukin-4 promoter polymorphism for associations with asthma and atopy // J Med Genet., 1996. — V. 33 (8). — Р. 689—692.
- Weiss S.T., Gold D.R. Gender differences in asthma // Pediatr. Pulmonol., 1995. — V. 19. — P. 153—155.
дипломов
Оставить комментарий